В 2017 году на территории парка реализуется проект по восстановлению жизнеспособных популяций Европейской жемчужницы (Margaritifera margaritifera L.), исчезающего вида европейской фауны. Финансирование осуществляется за счёт благотворительного гранта Всемирного фонда природы (WWF) и частного спонсора И.З Мгеладзе.
Практически все западно-европейские популяции находятся на грани вымирания. За последние десятилетия более половины из них исчезло, а большинство оставшихся перестали воспроизводиться. Основные причины исчезновения Жемчужницы в настоящее время — сокращение численности лососевых рыб, загрязнение и нарушение водотоков.
Многолетние мероприятия парка по охране и защите рыбы Кумжи и её нерестовых путей, привели к возобновлению стабильного естественного воспроизводства кумжи в реках парка. В настоящее время имеются все предпосылки для восстановления популяций Жемчужницы в реках национального парка «Паанаярви».